A estrutura organizacional da Faculdade Zarns de Itumbiara conta com os seguintes órgãos:
- Órgão Normativo e Deliberativo Superior: Comitê de Gestão.
- Órgão Executivo Superior: Direção.
- Órgão Normativo e Deliberativo de Graduação: Colegiado de Curso;
- Órgão Consultivo e de Assessoramento da Graduação: Núcleo Docente Estruturante – NDE;
- Órgãos Executivos Intermediários:
- Coordenação de Curso;
- Coordenação de Iniciação Científica, Extensão e Pós Graduação – CIEP; e
- Procurador Institucional.
- Órgãos Executivos Auxiliares:
- Secretaria Acadêmica;
- Biblioteca;
- Núcleo de Acessibilidade e Atendimento Psicopedagógico – NAAP;
- Núcleo de Acolhimento e Apoio ao Estudante – NAAE;
- Coordenação do Programa Institucional de Nivelamento – COPIN;
- Laboratórios Didáticos Especializados;
- Coordenação Financeira;
- Departamento de Tecnologia da Informação – DTI;
- Departamento de Comunicação e Marketing;
- Gerência Administrativa;
- Núcleo de Gestão de Pessoas
- Departamento de Patrimônio e Almoxarifado; e
- Departamento de Compras.
- Órgãos de Assessoria:
- Assessoria Jurídica; e
- Órgãos Independentes:
- Comissão Própria de Avaliação – CPA;
- Comissão Interna de Prevenção de Acidentes (quando houver);
- Comitê de Ética em Pesquisa; e
- Ouvidoria.